MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Edwardsiella tarda EIB202 plasmid pEIB202

Total Repeats: 95

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013509	TTG	2	6	4769	4774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013509	TGAAT	2	10	4792	4801	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013509	GT	4	8	5960	5967	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013509	CTCC	2	8	7386	7393	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5	NC_013509	AGC	2	6	10588	10593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_013509	CAG	2	6	10620	10625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_013509	CCT	2	6	10802	10807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_013509	GCC	2	6	11537	11542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_013509	CAT	2	6	14785	14790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_013509	TGC	2	6	14800	14805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_013509	CAAGG	2	10	14840	14849	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_013509	G	6	6	14963	14968	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013509	GAA	2	6	15065	15070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013509	A	6	6	15069	15074	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013509	ATA	2	6	15083	15088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013509	TAT	2	6	15098	15103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013509	CAC	3	9	15125	15133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_013509	CGG	2	6	15140	15145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_013509	ACA	2	6	15436	15441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_013509	AGG	2	6	15443	15448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013509	GGA	2	6	15470	15475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013509	ACC	2	6	15639	15644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_013509	GCCG	2	8	15658	15665	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_013509	TTG	2	6	18777	18782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013509	GAAC	2	8	18795	18802	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_013509	GGC	2	6	18828	18833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_013509	TTACAC	2	12	18875	18886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_013509	AGG	2	6	18906	18911	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013509	GGCG	2	8	19258	19265	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
30	NC_013509	TAT	2	6	19370	19375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013509	AGT	2	6	19398	19403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013509	TCCC	2	8	20785	20792	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
33	NC_013509	GCCG	2	8	20818	20825	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_013509	GGT	2	6	20870	20875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013509	CCCTT	2	10	20922	20931	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
36	NC_013509	TCT	2	6	20939	20944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_013509	TGT	2	6	20962	20967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013509	ATA	2	6	21216	21221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013509	TAT	2	6	21231	21236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013509	CAC	3	9	21258	21266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_013509	AAT	2	6	21783	21788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013509	AAT	2	6	21792	21797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013509	ATT	4	12	21801	21812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013509	TGT	2	6	22868	22873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013509	ACT	2	6	22893	22898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_013509	A	7	7	22922	22928	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013509	ATA	2	6	22936	22941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013509	TAT	2	6	22951	22956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013509	CAC	3	9	22978	22986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_013509	CTTT	2	8	23448	23455	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_013509	TGT	2	6	23465	23470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013509	CCT	2	6	25929	25934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_013509	CGC	2	6	25946	25951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_013509	GTG	3	9	25953	25961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013509	GCC	2	6	26526	26531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_013509	CGC	2	6	26534	26539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_013509	CAA	2	6	26587	26592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_013509	TGC	2	6	30149	30154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_013509	CGC	2	6	30248	30253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_013509	GGC	2	6	30260	30265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_013509	TGA	2	6	32061	32066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013509	TAA	4	12	32928	32939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013509	AGA	2	6	33028	33033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013509	TGG	2	6	33225	33230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013509	TA	3	6	33796	33801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013509	GATA	2	8	33811	33818	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013509	TAT	2	6	33833	33838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013509	A	6	6	33854	33859	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013509	A	6	6	33909	33914	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013509	GAT	2	6	33952	33957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013509	ATA	2	6	33958	33963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013509	CA	3	6	33972	33977	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_013509	ATA	2	6	34038	34043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013509	TTTAA	2	10	34072	34081	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013509	TTTA	2	8	34750	34757	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013509	TC	3	6	34784	34789	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_013509	TGGA	2	8	34794	34801	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013509	TAA	3	9	34841	34849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013509	GTCA	2	8	35266	35273	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_013509	T	7	7	35325	35331	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013509	CCAT	2	8	35362	35369	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_013509	GCAA	3	12	35406	35417	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_013509	TAAA	2	8	35516	35523	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013509	GAAAA	2	10	35539	35548	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013509	A	6	6	35545	35550	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013509	GAA	2	6	35630	35635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013509	G	6	6	35923	35928	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013509	C	6	6	35989	35994	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
89	NC_013509	C	6	6	35998	36003	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
90	NC_013509	CATC	2	8	36008	36015	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_013509	A	6	6	38063	38068	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013509	T	7	7	38083	38089	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013509	GCT	2	6	38915	38920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_013509	CAC	2	6	38921	38926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_013509	AGCG	2	8	38955	38962	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.